More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17000 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17000  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  100 
 
 		 323 aa  628  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  57.08 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.67 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.67 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.67 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.67 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  56.3 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.25 
 
 		 343 aa  278  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  56.25 
 
 		 343 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  56.72 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3160  ABC transporter related protein  54.28 
 
 		 332 aa  275  8e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0152583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2812  ABC transporter related protein  58.03 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.58 
 
 		 345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  50.9 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  52.92 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  62.28 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1547  ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2742  ABC transporter related  51.67 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2661  ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  53.31 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  51.99 
 
 		 354 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  53.3 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 350 aa  269  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.75 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 341 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  53.71 
 
 		 340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  52.89 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  53.07 
 
 		 344 aa  268  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  52.46 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.59 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  55.07 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 397 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03410  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  49.35 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0931  ABC-type metal ion transport system ATPase component  54 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  58.68 
 
 		 388 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.92 
 
 		 343 aa  265  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2001  methionine transport ATP-binding protein  45.98 
 
 		 351 aa  264  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.974934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.91 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  51.25 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  57.21 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 339 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  55.47 
 
 		 266 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0195  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0412  ABC transporter related  58.7 
 
 		 367 aa  262  6e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  50.66 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.08 
 
 		 344 aa  262  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.35 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  57.44 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  50.22 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.45 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.45 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.77 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.77 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.77 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.79 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.35 
 
 		 385 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.77 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2630  ABC transporter related  56.85 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.35 
 
 		 385 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.12 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  54.12 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2760  ABC transporter related  54.77 
 
 		 359 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0840965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  60.35 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.91 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0196  ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000216687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  58.33 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 		 368 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  49.35 
 
 		 339 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  62.45 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  59.91 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>