63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4328 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  683    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  55.09 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  47.63 
 
 
378 aa  255  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  43.37 
 
 
395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  33.93 
 
 
369 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  38.37 
 
 
367 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  36.13 
 
 
384 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  29.97 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  26.01 
 
 
357 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  31.83 
 
 
412 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  25.89 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  35.21 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  33.98 
 
 
362 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  32.63 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  28.75 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  35.11 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  29.03 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  30.72 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  29.91 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  30.72 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  30.91 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  35.03 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  30.48 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  29.64 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  29.67 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  31.05 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  31.87 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  32.35 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  28.48 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  31.29 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  31.74 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  32.13 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  31.19 
 
 
398 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  28.88 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  19.93 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  30.49 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  33.54 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  30.72 
 
 
373 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  18.37 
 
 
367 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  29.72 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  28.62 
 
 
384 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  30.07 
 
 
362 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  31.16 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  32.41 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  29.43 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  29.57 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3558  hypothetical protein  41.49 
 
 
390 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  29.56 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  30.21 
 
 
375 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  28.01 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  26.17 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  28.16 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  29.7 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  26.35 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  30.37 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  30.95 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  30.18 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  29.62 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  29.13 
 
 
355 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  29.13 
 
 
355 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  30.68 
 
 
396 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  29.41 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  28.65 
 
 
394 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>