82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0001 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0001  tRNA-Ile  97.33 
 
 		 77 bp  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0001  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14001  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226648  normal  0.0173253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484512  normal  0.062918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0001  tRNA-Ile  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0001  tRNA-Ile  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.522467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0001  tRNA-Ile  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00090  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609024  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00090  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0001  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0004  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0654807  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  95.31 
 
 		 74 bp  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00080  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0001  tRNA-Ile  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.996709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0001  tRNA-Ile  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1353  tRNA-Ile  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0051  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0040  tRNA-Ile  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.22275  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0077  tRNA-Ile  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0001  tRNA-Ile  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0441602 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0054  tRNA-Ile  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0041  tRNA-Ile  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0036  tRNA-Ile  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0058  tRNA-Ile  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124982  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0044  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000172197  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09730  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000907355  hitchhiker  0.0000119481 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0014  tRNA-Ile  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2187  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1706  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0593  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1273  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2230  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2237  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2258  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2322  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1522  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2158  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0016  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000285507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0027  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0032  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0214663  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0034  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1726  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1713  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt04  tRNA-Ile  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0697106  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt46  tRNA-Ile  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt37  tRNA-Ile  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_002950  PGt31  tRNA-Ile  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0462  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.81468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0519  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tIle01  tRNA-Ile  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1463  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>