More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0034 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0034  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2230  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2237  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2322  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2258  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127435  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0593  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.234986  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1706  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1713  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1726  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1522  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2158  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1273  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2187  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1463  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0462  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.81468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0519  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0457  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0382527  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0078  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.236946  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1509  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0058  tRNA-Ile  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0045  tRNA-Ile  91.94 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000457584  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0035  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1610  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0003  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00141383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0010  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0680971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0018  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0178227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0025  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0236183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0081  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0016  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0054  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000202607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0007  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000911687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0114  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000347317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0067  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000189357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0098  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t050  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331004  hitchhiker  0.0000227439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t003  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t064  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t096  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0157  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.131945  hitchhiker  0.00000102805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0051  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0025  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0513291  unclonable  0.00000384252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0081  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000962065  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t042  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0159624  hitchhiker  0.000000229903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t009  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0011  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0129022  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0175  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0008  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0093  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879368  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0020  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0504823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0008  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.160787  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0021  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000203116  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0005  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000734395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0062  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00713608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0160  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0152441  normal  0.0451567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0149  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00584205  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0008  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154963  normal  0.549393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0070  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000447214  normal  0.107395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0135  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000335927  normal  0.0144188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0137  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000306582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0117  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183962  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  97.62 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 80 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0007  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0223  tRNA-Ile  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0090777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0019  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.522587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0046  tRNA-Ile  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>