22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1615 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1615  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  824    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0869  hypothetical protein  71.91 
 
 
392 aa  558  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2106  hypothetical protein  63.92 
 
 
379 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0725633 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06420  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  61.26 
 
 
407 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224562  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  32.38 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  31.99 
 
 
370 aa  193  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  33.14 
 
 
403 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  31.56 
 
 
406 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  26.95 
 
 
372 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  29.04 
 
 
397 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  28.62 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  25.69 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  20.79 
 
 
317 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  22.6 
 
 
330 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.85 
 
 
388 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  23.32 
 
 
334 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  22.3 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  22.35 
 
 
375 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0413  hypothetical protein  43.1 
 
 
213 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  26.92 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3446  hypothetical protein  65.62 
 
 
205 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  23.48 
 
 
363 aa  43.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>