144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4198 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
117 aa  238  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  43.75 
 
 
126 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  43.75 
 
 
129 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  44.44 
 
 
127 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  44.44 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  42.11 
 
 
127 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  39.37 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  40.37 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  40.91 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  40.91 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  40.78 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  34.78 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.15 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  33.63 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  39.39 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  30.09 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  33.64 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  37.37 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.14 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.97 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  57.78 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  39.58 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  33.86 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1118  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.3 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  30.09 
 
 
135 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  30.83 
 
 
135 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  37.74 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  37.74 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  31.09 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.69 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  30.17 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  35.4 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  30.43 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  36.19 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2338  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.05 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  32.79 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  29.84 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  30.28 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
138 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  30.63 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  26.96 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  27.59 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2994  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.04 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140611 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.67 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1386  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.55 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.37 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.65 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  35.96 
 
 
130 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1477  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.48 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3954  flagellar basal-body rod protein FlgB  44.93 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0184  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.78 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  40.51 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1259  flagellar basal body rod protein FlgB  37.65 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1329  flagellar basal body rod protein FlgB  37.65 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1321  flagellar basal body rod protein FlgB  38.1 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2324  flagellar basal body rod protein FlgB  41.38 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1998  flagellar basal body rod protein FlgB  41.38 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2425  flagellar basal body rod protein FlgB  41.38 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.395558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004173  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.2 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  34.62 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  28.7 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  34.48 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3020  flagellar basal body rod protein FlgB  56.1 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3250  flagellar basal body rod protein FlgB  38.1 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  33.61 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  32.08 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  26.5 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  28.97 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.63 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  29.25 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  35.9 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  45.45 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.46 
 
 
153 aa  43.5  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  34.75 
 
 
130 aa  43.5  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  50 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0893  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.36 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.46 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0462  flagellar basal body rod protein FlgB  67.74 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0240  flagellar basal body rod protein FlgB  67.74 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2994  flagellar basal body rod protein FlgB  67.74 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2099  flagellar basal body rod protein FlgB  67.74 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0266  flagellar basal body rod protein FlgB  67.74 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2970  flagellar basal body rod protein FlgB  41.51 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>