49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1368 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  100 
 
 
420 aa  844    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  75.48 
 
 
420 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  66.51 
 
 
441 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  66.51 
 
 
422 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  68.66 
 
 
422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  68.19 
 
 
422 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  57.28 
 
 
425 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  58.78 
 
 
426 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  58.79 
 
 
424 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  59.3 
 
 
424 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  60.1 
 
 
417 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  54.48 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  54.4 
 
 
431 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  51.1 
 
 
435 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  48.68 
 
 
423 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  51.8 
 
 
446 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  49.16 
 
 
420 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  50.25 
 
 
428 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  51.29 
 
 
475 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  50.65 
 
 
441 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  47.47 
 
 
417 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  50.9 
 
 
445 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  50.65 
 
 
445 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  51.18 
 
 
452 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  50.66 
 
 
458 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  50.38 
 
 
444 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  50.38 
 
 
443 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  50.64 
 
 
448 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  49.61 
 
 
445 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  45.24 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  37.6 
 
 
428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  42.38 
 
 
482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  37.02 
 
 
480 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  39.55 
 
 
441 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  42.58 
 
 
399 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  37.95 
 
 
407 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  36.89 
 
 
400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  38.35 
 
 
429 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  36.24 
 
 
410 aa  206  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  28.53 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  24.79 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  23.23 
 
 
382 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  36.14 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  33.57 
 
 
374 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  25.46 
 
 
359 aa  46.6  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  25.16 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  24.27 
 
 
387 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.36 
 
 
387 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  31.37 
 
 
391 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>