19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1097 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1097  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.68714  decreased coverage  0.00547678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  31.69 
 
 		 465 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  32.17 
 
 		 447 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  31.85 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  32.17 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  33.77 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  40 
 
 		 833 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  29.94 
 
 		 398 aa  44.7  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  27.01 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  34.92 
 
 		 469 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  28.87 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  33.59 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  28.07 
 
 		 425 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  35.44 
 
 		 418 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  45.16 
 
 		 319 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 		 792 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  34.38 
 
 		 346 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  30.37 
 
 		 387 aa  42  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  35 
 
 		 452 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>