30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1086 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1857  hypothetical protein  46.37 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251618  normal  0.571034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  34.09 
 
 
258 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  30.58 
 
 
263 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  28.76 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  29.82 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.31 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  25.94 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  26.58 
 
 
291 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  26.58 
 
 
291 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  26.58 
 
 
291 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  29.87 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.51 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  25.35 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  26.32 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  31.2 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  28.37 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  29.81 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  28.93 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  30.68 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.89 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  26.76 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  27.32 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  29.19 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  25.62 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>