66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2908 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 		 132 aa  254  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  77.44 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  72.79 
 
 		 136 aa  187  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  71.01 
 
 		 138 aa  183  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  66.67 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  53.85 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46.56 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.45 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.2 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.71 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  48.44 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  48.33 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  46.77 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  47.62 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  45.16 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  43.33 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  49.21 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  49.21 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  42.25 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  49.21 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  45 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  41.54 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  47.46 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.67 
 
 		 262 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  52.46 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  37.7 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  49.12 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  49.18 
 
 		 261 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  37.7 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 457 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.33 
 
 		 202 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 456 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1372  translation initiation factor IF-2 subunit beta  32.1 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1622  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  50.77 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  38.98 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  34.33 
 
 		 458 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  37.93 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3330  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.67 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2830  Translation initiation factor IF2/IF5  40 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 		 454 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1021  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  36.07 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  40 
 
 		 256 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 458 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 460 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1390  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.33 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 458 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  36.07 
 
 		 458 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  41.18 
 
 		 473 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  36.07 
 
 		 454 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  36.07 
 
 		 454 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  40 
 
 		 455 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2542  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.85 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  40 
 
 		 455 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0985  Translation initiation factor IF2/IF5  37.14 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.849775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  35.38 
 
 		 471 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0779  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.7 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.157582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1324  Translation initiation factor IF2/IF5  36.07 
 
 		 203 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  35.9 
 
 		 456 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  35 
 
 		 204 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>