28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2250 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2250  tRNA CCA-pyrophosphorylase  100 
 
 		 450 aa  885    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.218879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0562  tRNA cytidylyltransferase  67.33 
 
 		 450 aa  587  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.26699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0418  CCA-adding enzyme  62.45 
 
 		 494 aa  564  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2208  CCA-adding enzyme  63.56 
 
 		 497 aa  548  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0336  tRNA CCA-pyrophosphorylase  63.28 
 
 		 462 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.0285087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0013  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.69 
 
 		 465 aa  346  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  45.86 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0323  tRNA CCA-pyrophosphorylase  45.25 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1130  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.29 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0015444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2014  tRNA CCA-pyrophosphorylase  42.26 
 
 		 454 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0644301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2808  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.13 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0369  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.59 
 
 		 464 aa  309  5e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0675  tRNA CCA-pyrophosphorylase  43.18 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0511  CCA-adding enzyme  36.48 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0196  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.38 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.79483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0756  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.14 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.155952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1706  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.56 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.71826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0240  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.17 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.788854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1256  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.87 
 
 		 464 aa  255  9e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.162335  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0570  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.58 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.07195  hitchhiker  0.00173806 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0998  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.64 
 
 		 455 aa  223  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465929  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1740  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.9 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.753345  decreased coverage  0.000389887 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1737  tRNA CCA-pyrophosphorylase  33.82 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.672198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1560  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.55 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2010  CCA-adding enzyme  34.08 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1782  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29 
 
 		 443 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1784  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.75 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0368  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.75 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.243596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>