25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4909 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 
276 aa  565  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  79.35 
 
 
276 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2938  hypothetical protein  58.97 
 
 
277 aa  341  9e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  29.96 
 
 
276 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1880  ORF H1617  33.07 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.851213  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1882  hypothetical protein  28.46 
 
 
271 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  31.39 
 
 
270 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  29 
 
 
276 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3303  transcriptional regulator protein-like protein  29.65 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102751  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0195  hypothetical protein  25.58 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  30.23 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0826  hypothetical protein  27.27 
 
 
194 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2423  hypothetical protein  26.12 
 
 
202 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4574  hypothetical protein  26.28 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437599  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  25.93 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3083  transcriptional regulator-like protein  30.38 
 
 
200 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6340  hypothetical protein  29.46 
 
 
205 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2055  hypothetical protein  30.08 
 
 
200 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1304  hypothetical protein  29.23 
 
 
197 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1932  hypothetical protein  38.57 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3048  hypothetical protein  30.56 
 
 
187 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  25.21 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0653  hypothetical protein  37.14 
 
 
204 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.921551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0752  hypothetical protein  30.83 
 
 
203 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.340996  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0507  hypothetical protein  37.14 
 
 
203 aa  42  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.689219  normal  0.235286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>