39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4287 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
132 aa  268  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  84.62 
 
 
131 aa  221  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  41.88 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  43.52 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  41.59 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  38.53 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  38.94 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  36.36 
 
 
115 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  34.91 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  37.25 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  35.85 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  38.74 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  38.38 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  35.45 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  33.02 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  33.33 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  35.92 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  34.44 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  34.19 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0245  hypothetical protein  35.78 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305068  normal  0.0996387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0946  hypothetical protein  33.94 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  34.95 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  32.23 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  35.14 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  33.88 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  31.9 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  28.1 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  28.97 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  27.83 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  29.81 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  29.41 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  31.25 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  29.47 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  29.82 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  28.57 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  42  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>