39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3743 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3743  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  486  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1961  Rhodanese domain protein  40.33 
 
 
244 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 
146 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
151 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 
129 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  28.93 
 
 
164 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
129 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  27.67 
 
 
164 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
136 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  27.34 
 
 
169 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  27.33 
 
 
177 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 
226 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  30.28 
 
 
170 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
142 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  25.87 
 
 
142 aa  48.9  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  28.74 
 
 
167 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  30.7 
 
 
172 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  30.61 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
123 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  26.79 
 
 
173 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32 
 
 
147 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  28.3 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 
125 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 
144 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  35.9 
 
 
311 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 
349 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 
342 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  33.02 
 
 
107 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  29.07 
 
 
102 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.93 
 
 
354 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  31.03 
 
 
330 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
216 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 
159 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
480 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  31.03 
 
 
330 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>