27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3239 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3239  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  185  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  62.79 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4025  hypothetical protein  57.78 
 
 
50 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.65 
 
 
284 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  37.21 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  34.48 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  36.05 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  38.37 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  38.37 
 
 
317 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  32.94 
 
 
309 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  34.88 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  31.03 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  29.89 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  29.89 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  29.89 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  29.89 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  29.89 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  36.78 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  29.55 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  29.55 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  27.59 
 
 
121 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  31.4 
 
 
914 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  31.4 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  29.27 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  28.41 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  30.59 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  26.44 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>