38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22900 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  28.47 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22890  lipopolysaccharide biosynthesis protein  54.39 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.95 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  27.51 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  26.62 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  49.02 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  56.1 
 
 		 474 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  23.35 
 
 		 445 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.73 
 
 		 464 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  23.02 
 
 		 624 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22870  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  23.59 
 
 		 370 aa  50.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0357  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 247 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  23.28 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.03 
 
 		 671 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 653 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  23.37 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  22.82 
 
 		 757 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0945  lipopolysaccharide biosynthesis protein  48.72 
 
 		 625 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  37.04 
 
 		 747 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  32.14 
 
 		 751 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.02 
 
 		 720 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  38.18 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  32.73 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.5 
 
 		 642 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.5 
 
 		 643 aa  42.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23360  O-antigen chain length regulator  27.97 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000253152  hitchhiker  0.00753817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>