49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3868 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  100 
 
 		 441 aa  889    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  48.21 
 
 		 428 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  46.01 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  44.73 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  46.01 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  42.75 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  41.54 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  43.89 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  44 
 
 		 441 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  44.61 
 
 		 445 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  41.13 
 
 		 420 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  43.39 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  43.39 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  40.89 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  39.46 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  40.57 
 
 		 435 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  39.23 
 
 		 475 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  42.97 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  41.69 
 
 		 417 aa  266  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  42.46 
 
 		 458 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  42.12 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  42.36 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  38.46 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  40.61 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  39.85 
 
 		 424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  39.55 
 
 		 420 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  38.35 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  36.91 
 
 		 441 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  33.47 
 
 		 486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  38.01 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  37.75 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  40.6 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  36.14 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  38.86 
 
 		 422 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  37.17 
 
 		 482 aa  222  9e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  35.77 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  39.01 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  33.9 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  33.08 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  24.47 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  24.53 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  24.02 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0694  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  23.71 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  23.06 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  24.39 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  24.18 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  24.92 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  23.81 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>