39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1550 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  60.38 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  51.72 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  53.7 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  55.56 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  55.56 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  55.56 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  45.76 
 
 
64 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  54.72 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  48.21 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  48.21 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  49.09 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  47.46 
 
 
62 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  54.17 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  45.76 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  56.6 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  42.31 
 
 
58 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  47.06 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  65.12 
 
 
58 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  48.84 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  52.38 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  46.34 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1885  hypothetical protein  67.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1863  hypothetical protein  66.04 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0931519  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2054  hypothetical protein  66.04 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  39.53 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1590  hypothetical protein  51.72 
 
 
58 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  40.91 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  41.51 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1731  hypothetical protein  67.92 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1316  hypothetical protein  55.93 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.153432  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  40.91 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  48.15 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  44.07 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  45.1 
 
 
489 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0402  hypothetical protein  44 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00151461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>