More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0711 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  100 
 
 
89 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 
89 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.27 
 
 
89 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.42 
 
 
83 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.72 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  51.14 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.68 
 
 
91 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  60.67 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.73 
 
 
89 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  57.3 
 
 
89 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.76 
 
 
89 aa  88.6  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  87  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  57.3 
 
 
89 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.59 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.86 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  53.57 
 
 
93 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24120  flagellar biosynthetic protein  60.67 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.94 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 
89 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.98 
 
 
89 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  46.59 
 
 
92 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.12 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3441  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.43 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.56 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.11 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2161  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.55 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.32 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.82 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.44 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  47.19 
 
 
91 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  47.73 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.43 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0576  flagellar biosynthesis protein  48.31 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.68 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  43.53 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  45.45 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.05 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  40.45 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.71 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.82 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  43.82 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2918  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.86 
 
 
89 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.198068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.07 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.91 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2216  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.45 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.886542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1611  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.18 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  46.07 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>