35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3001 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 364 aa  707    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.1 
 
 		 386 aa  343  4e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.83 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.64 
 
 		 299 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.07 
 
 		 322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  38.28 
 
 		 253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  33.54 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.58 
 
 		 238 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.48 
 
 		 255 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.86 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  30.56 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.89 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.55 
 
 		 221 aa  98.2  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  29.09 
 
 		 278 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3204  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.61 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.55 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.8 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.19 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  25.46 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  23.13 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.63 
 
 		 256 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.63 
 
 		 256 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.84 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.19 
 
 		 285 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  29.03 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  36.05 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  27.24 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.1 
 
 		 285 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.95 
 
 		 273 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  36.36 
 
 		 273 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  37.14 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  39.44 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.9 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.65 
 
 		 259 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>