40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1053 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  48.21 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  47.86 
 
 
117 aa  104  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  45.28 
 
 
119 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  44.64 
 
 
116 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  45.87 
 
 
114 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  45.95 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  40.57 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  35.09 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  38.32 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  38.32 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  35.35 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  37.19 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  35.96 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  34.26 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.45 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  46.67 
 
 
110 aa  67  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  35.4 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  31.53 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  34.91 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  35.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  43.06 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  38.1 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  30.17 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  28.83 
 
 
125 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  30.1 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  30.53 
 
 
129 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0147  hypothetical protein  28.26 
 
 
119 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  24.39 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  28.92 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  29.59 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  28.42 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  31.58 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  28.89 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  28.26 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>