25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3330 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3330  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  100 
 
 		 265 aa  530  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2835  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  42.15 
 
 		 262 aa  192  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1452  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  44.49 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0640  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  24.51 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0611844  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1071  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  25.73 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1185  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  26.38 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2324  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  25.38 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.470666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2662  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  27.78 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0538  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.51 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0622  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.93 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3203  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  28.21 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0939  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  28.95 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0268  CRISPR-associated Cas5h family protein  24.47 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0307  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  24.63 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0974  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  26.22 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4289  CRISPR-associated protein Cas5  34.43 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0769  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.27 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2519  hypothetical protein  25.62 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2427  CRISPR-associated protein Cas5  21.8 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.474522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15230  CRISPR-associated protein Cas5  30.16 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.331137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1020  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.02 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1880  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  20.61 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0352  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.26 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00575907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  27.81 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1421  CRISPR-associated protein Cas5  18.78 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>