29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1020 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1020  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3203  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  32.91 
 
 
237 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0640  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  37.2 
 
 
233 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0611844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1880  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  32.34 
 
 
242 aa  118  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1071  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  28.92 
 
 
256 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0622  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  30.25 
 
 
238 aa  98.6  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2519  hypothetical protein  34.38 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1185  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.51 
 
 
247 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0268  CRISPR-associated Cas5h family protein  27.35 
 
 
258 aa  88.6  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0232  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  28.81 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0939  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.85 
 
 
236 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2662  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  31.11 
 
 
250 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2427  CRISPR-associated protein Cas5  27.07 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.474522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0307  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.21 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0974  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  30.8 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2324  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  28.15 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.470666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2835  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  26.34 
 
 
262 aa  71.6  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0538  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  25.62 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  26.44 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1421  CRISPR-associated protein Cas5  30.77 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0769  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.09 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9944  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1452  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  24.9 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1291  RDD protein  30.88 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3867  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.22 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260303  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4289  CRISPR-associated protein Cas5  34.94 
 
 
253 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15230  CRISPR-associated protein Cas5  29.73 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.331137  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3330  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.02 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0397  CRISPR-associated protein Cas5, hmari subtype  28.22 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1806  hypothetical protein  23.56 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>