25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1421 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1421  CRISPR-associated protein Cas5  100 
 
 
236 aa  487  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1291  RDD protein  67.66 
 
 
201 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0538  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.89 
 
 
242 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1071  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.31 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29878  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0640  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.03 
 
 
233 aa  79  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0611844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1020  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  30.77 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0307  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  20.78 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0939  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  24.19 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1185  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  22.67 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3203  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.42 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0622  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  27.75 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2324  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  29.27 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.470666  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2427  CRISPR-associated protein Cas5  21.9 
 
 
264 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.474522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2662  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  24.56 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0232  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.01 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1124  hypothetical protein  26.38 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0974  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.11 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  22.07 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0769  CRISPR-associated Cas5 family protein  45.45 
 
 
233 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1880  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.17 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4289  CRISPR-associated protein Cas5  29.21 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0662  CRISPR-associated protein Cas5, hmari subtype  44.9 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3493  fruiting body developmental protein S-like protein  24.11 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0201089  normal  0.0546603 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3330  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  18.78 
 
 
265 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15230  CRISPR-associated protein Cas5  31.82 
 
 
238 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.331137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>