25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0769 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0769  CRISPR-associated Cas5 family protein  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15230  CRISPR-associated protein Cas5  40 
 
 
238 aa  168  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.331137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2324  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  35.15 
 
 
236 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.470666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0939  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  34.68 
 
 
236 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2662  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  34.98 
 
 
250 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0974  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  30.77 
 
 
266 aa  98.2  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0640  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.64 
 
 
233 aa  95.1  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0611844  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2427  CRISPR-associated protein Cas5  28.69 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.474522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4289  CRISPR-associated protein Cas5  29.09 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0268  CRISPR-associated Cas5h family protein  26.67 
 
 
258 aa  91.7  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3203  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.93 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1071  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  24.6 
 
 
256 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0622  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.05 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1020  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.09 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0307  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  21.88 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1452  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.56 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0538  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  22.67 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1185  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  22.47 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2519  hypothetical protein  22.12 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3330  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  29.27 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  23.85 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2835  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.64 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1880  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  24.76 
 
 
242 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1421  CRISPR-associated protein Cas5  45.45 
 
 
236 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1124  hypothetical protein  44.19 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>