24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0268 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0268  CRISPR-associated Cas5h family protein  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2427  CRISPR-associated protein Cas5  56.32 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.474522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2324  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  30.87 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.470666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0939  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  32.05 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0974  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  34.4 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0640  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  30.64 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0611844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4289  CRISPR-associated protein Cas5  31.53 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2662  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  30.84 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3203  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.07 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0307  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  26.41 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1071  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.43 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1185  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.33 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0622  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.15 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1880  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.99 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0769  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.67 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9944  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1020  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.35 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15230  CRISPR-associated protein Cas5  31.06 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.331137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2835  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  30.86 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3330  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  24.47 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1452  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.31 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2519  hypothetical protein  27.35 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0232  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.21 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0538  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.57 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  27.7 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>