28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0538 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0538  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1421  CRISPR-associated protein Cas5  23.89 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0939  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.2 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1452  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  27.24 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2835  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.85 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1071  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  27.71 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.29878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1020  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  25.62 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3330  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.51 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0640  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  22.18 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0611844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2662  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  26.21 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1880  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.7 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4289  CRISPR-associated protein Cas5  45.59 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0232  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  24.19 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0769  CRISPR-associated Cas5 family protein  22.67 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.9944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0307  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  28.57 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1185  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  23.75 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3203  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  26.78 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2324  CRISPR-associated Cas5 family Hmari subtype protein  23.87 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.470666  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0397  CRISPR-associated protein Cas5, hmari subtype  23.92 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0268  CRISPR-associated Cas5h family protein  26.57 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15230  CRISPR-associated protein Cas5  36.84 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.331137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0974  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  46.94 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2519  hypothetical protein  23.81 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2427  CRISPR-associated protein Cas5  43.48 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.474522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3937  CRISPR-associated protein Cas5  27.53 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0218624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1124  hypothetical protein  21.43 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0662  CRISPR-associated protein Cas5, hmari subtype  40.43 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0622  CRISPR-associated protein Cas5, Hmari subtype  24.84 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>