73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0552 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0552  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 		 138 aa  266  5.9999999999999995e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0697553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2908  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  71.01 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3210  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  64.49 
 
 		 136 aa  174  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217613  normal  0.112347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1298  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  66.91 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2770  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  62.68 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.776355  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4614  cyclic nucleotide-binding protein  53.68 
 
 		 134 aa  140  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3644  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.23 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3306  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.83 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3102  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.45 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1299  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.31 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0581  deoxyribonuclease  48.68 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0304  hypothetical protein  56.67 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0604  hypothetical protein  57.63 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0082041  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1445  RNA-binding protein  59.32 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1431  deoxyribonuclease  50 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0835  deoxyribonuclease  54.69 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1027  hypothetical protein  55 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1026  hypothetical protein  53.33 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0872  deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1075  deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1601  deoxyribonuclease  52.63 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.919266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1025  hypothetical protein  48.33 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1239  deoxyribonuclease  34.57 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.331462  hitchhiker  0.00677702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1028  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0453  deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1019  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.67 
 
 		 262 aa  52  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.35921 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1667  deoxyribonuclease  41.43 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0180  translation initiation factor IF-2 subunit beta  43.33 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1143  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  37.7 
 
 		 255 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1613  deoxyribonuclease  42.37 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0165  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  46.67 
 
 		 261 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  41.67 
 
 		 454 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2048  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  47.54 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 458 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1622  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.07 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  42.62 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  42.62 
 
 		 454 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 460 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  42.62 
 
 		 458 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 458 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 458 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  42.62 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  42.62 
 
 		 454 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  37.5 
 
 		 460 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 457 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  41.54 
 
 		 471 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  47.27 
 
 		 460 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  32.2 
 
 		 456 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3260  23S RNA methyltransferase J  45.9 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0985526  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  39.62 
 
 		 436 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  41.07 
 
 		 455 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1089  deoxyribonuclease  50.85 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1249  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00922141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  35 
 
 		 458 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  38.98 
 
 		 451 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1792  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  41.67 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2542  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.38 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  43.14 
 
 		 473 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1423  translation initiation factor IF-2 subunit beta  37.1 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  40.68 
 
 		 448 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1021  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  32.79 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3330  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  43.14 
 
 		 465 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.9 
 
 		 455 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 455 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1821  deoxyribonuclease  34.48 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  37.5 
 
 		 453 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  42.31 
 
 		 455 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0080  translation initiation factor IF-2 subunit beta  33.8 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  33.93 
 
 		 461 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  33.93 
 
 		 461 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>