52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2380 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2380  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1366    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.573716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1523  outer membrane protein precursor MtrB  26.69 
 
 		 703 aa  174  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2700  outer membrane protein precursor MtrB  25.79 
 
 		 699 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.140373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2527  outer membrane protein precursor MtrB  25.41 
 
 		 699 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3127  outer membrane protein precursor MtrB  25.97 
 
 		 698 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2819  outer membrane protein  25.04 
 
 		 674 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1403  outer membrane protein  25.68 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0228  outer membrane protein  25.72 
 
 		 669 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2639  outer membrane protein precursor MtrB  23.8 
 
 		 695 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.381518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1428  outer membrane protein  25.46 
 
 		 662 aa  143  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1776  outer membrane protein precursor MtrB  24.33 
 
 		 697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2580  outer membrane protein precursor MtrB  25.43 
 
 		 695 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0892811  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0626  outer membrane protein  25.15 
 
 		 662 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2512  outer membrane protein precursor MtrB  25.43 
 
 		 695 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.481344  hitchhiker  0.00380912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1610  outer membrane protein precursor MtrB  25 
 
 		 695 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1206  outer membrane protein precursor MtrB  25.41 
 
 		 693 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00712734  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1587  outer membrane protein precursor MtrB  25.16 
 
 		 695 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.14869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1576  outer membrane protein precursor MtrB  25 
 
 		 695 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0247408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2767  outer membrane protein precursor MtrB  25 
 
 		 695 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38459  decreased coverage  0.0000000195366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2678  outer membrane protein precursor MtrB  25.27 
 
 		 695 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0120666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3129  outer membrane protein  24.89 
 
 		 668 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2924  outer membrane protein  26.32 
 
 		 672 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0232  outer membrane protein  26.18 
 
 		 668 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1476  outer membrane protein precursor MtrB  24.73 
 
 		 704 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0583388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3685  outer membrane protein  23.12 
 
 		 669 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0351  outer membrane protein  24.4 
 
 		 668 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.132929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2575  outer membrane protein, putative  22.28 
 
 		 712 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.382223  normal  0.0100753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1212  outer membrane protein, putative  22.37 
 
 		 698 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2693  outer membrane protein, putative  23.83 
 
 		 706 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1529  outer membrane protein, putative  22.64 
 
 		 711 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1592  outer membrane protein, putative  21.89 
 
 		 716 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000338536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2507  outer membrane protein, putative  21.9 
 
 		 712 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767045  decreased coverage  0.000584641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2673  outer membrane protein, putative  22.17 
 
 		 712 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335311  normal  0.0727867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2520  outer membrane protein, putative  21.33 
 
 		 703 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.383126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1781  outer membrane protein, putative  21.26 
 
 		 712 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2762  outer membrane protein, putative  21.3 
 
 		 716 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00885909  hitchhiker  0.000163865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1581  outer membrane protein, putative  21.15 
 
 		 716 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0408477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1615  outer membrane protein, putative  20.89 
 
 		 716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.208848  normal  0.197166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1403  hypothetical protein  23.1 
 
 		 772 aa  112  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142579  normal  0.0825928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2229  outer membrane protein  23.41 
 
 		 667 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00516967  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0267  outer membrane protein  23.76 
 
 		 667 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3676  outer membrane protein  23.09 
 
 		 667 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003778  outer membrane protein  21.99 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4081  hypothetical protein  23.29 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0596135  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1306  outer membrane protein  22.46 
 
 		 672 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2959  putative outer membrane protein precursor  22.07 
 
 		 830 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0816  hypothetical protein  22.79 
 
 		 810 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2150  outer membrane protein  21.58 
 
 		 669 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0260254  normal  0.662224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3627  hypothetical protein  20.25 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4359  outer membrane protein, putative  23.15 
 
 		 656 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0360  hypothetical protein  24.6 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0310928  hitchhiker  0.00101277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0398  hypothetical protein  21.86 
 
 		 807 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.513046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>