More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0140 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
399 aa  790    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
407 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.95 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 
396 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.34 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.73 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
395 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.24 
 
 
402 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
395 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
390 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
414 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
422 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.79 
 
 
377 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
384 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  32.64 
 
 
413 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
414 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
405 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  31.36 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0611  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
375 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
381 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.55 
 
 
382 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
383 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.07 
 
 
381 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
381 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
383 aa  136  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  29.94 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0599  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.08 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.06 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000188362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.02 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2891  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
383 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339449  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  31.23 
 
 
381 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.45 
 
 
397 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.52 
 
 
380 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
388 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.04 
 
 
400 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 
400 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
392 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.04 
 
 
400 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
382 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  34.11 
 
 
395 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  34.5 
 
 
395 aa  123  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  34.11 
 
 
395 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  34.11 
 
 
395 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  34.11 
 
 
395 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
388 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  34.11 
 
 
395 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.61 
 
 
388 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0678  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
389 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 
380 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
395 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  34.11 
 
 
395 aa  123  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4700  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
377 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.6 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  31.02 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3155  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1612  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.38 
 
 
400 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.38 
 
 
400 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.58 
 
 
388 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
379 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144236  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  31.02 
 
 
395 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  31.02 
 
 
395 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  31.02 
 
 
395 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
384 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
380 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691454  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  30.69 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2526  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
378 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
391 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2157  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
380 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
382 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.19 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  30.21 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
387 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02531  hypothetical protein  31.87 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3875  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0793406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>