27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4999 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  100 
 
 
802 aa  1661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  28.83 
 
 
749 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  31.07 
 
 
752 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 
756 aa  158  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  31.47 
 
 
756 aa  159  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  31.24 
 
 
757 aa  157  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  28.47 
 
 
749 aa  157  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 
600 aa  155  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  30.09 
 
 
759 aa  153  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  31.22 
 
 
756 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  27.99 
 
 
760 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  28.54 
 
 
1098 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  30.77 
 
 
768 aa  151  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  31.24 
 
 
759 aa  150  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  31.47 
 
 
759 aa  150  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  30.25 
 
 
759 aa  150  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  31 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  26.36 
 
 
759 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  29.47 
 
 
757 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  24.94 
 
 
1116 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  28.31 
 
 
562 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 
788 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  30.45 
 
 
502 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  27.07 
 
 
861 aa  90.5  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  27.81 
 
 
991 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  25.18 
 
 
1118 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  23.24 
 
 
1117 aa  48.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>