21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3736 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3736  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  277  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4471  hypothetical protein  37.5 
 
 
377 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.181787  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  36.52 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1709  cytochrome c class I  28.57 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1188  hypothetical protein  37.27 
 
 
351 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2778  hypothetical protein  37.21 
 
 
335 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.687972  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  26.36 
 
 
272 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  31.31 
 
 
408 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  27.69 
 
 
351 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 
337 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 
337 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  25.89 
 
 
290 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  37.21 
 
 
399 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  33.03 
 
 
920 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  25 
 
 
290 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 
344 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  38.55 
 
 
1143 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  29.9 
 
 
444 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  31.11 
 
 
384 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 
362 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
314 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>