43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1709 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1709  cytochrome c class I  100 
 
 
129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  39.76 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1188  hypothetical protein  40.45 
 
 
351 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4471  hypothetical protein  40.45 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.181787  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3736  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2778  hypothetical protein  30.47 
 
 
335 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.687972  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  32.43 
 
 
272 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  34.23 
 
 
277 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  33.33 
 
 
290 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  32.43 
 
 
290 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 
344 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  34 
 
 
330 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  36.36 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 
358 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.69 
 
 
330 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  36.17 
 
 
278 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 
356 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  34.41 
 
 
278 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
399 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  34.04 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  34.31 
 
 
349 aa  42  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  32.58 
 
 
301 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  30.69 
 
 
275 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  34.04 
 
 
278 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  34.04 
 
 
278 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  34.41 
 
 
280 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  27.55 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  28.95 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  25.21 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  33.33 
 
 
444 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  24.74 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  28.45 
 
 
169 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  31.78 
 
 
356 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>