More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0226 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
118 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  76.79 
 
 
116 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2561  50S ribosomal protein L19  74.11 
 
 
116 aa  152  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000880835  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2781  50S ribosomal protein L19  72.32 
 
 
116 aa  149  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655123  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  66.07 
 
 
118 aa  147  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 
128 aa  140  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
115 aa  140  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 
113 aa  139  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  59.83 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 
115 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  64.55 
 
 
118 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 
130 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
118 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 
119 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  64.55 
 
 
116 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 
119 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
114 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  62.5 
 
 
114 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 
120 aa  134  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 
113 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
127 aa  133  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
114 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  60.71 
 
 
124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
116 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
159 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 
162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
125 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
115 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 
115 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  60.53 
 
 
119 aa  127  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  56.41 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  59.26 
 
 
118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  52.85 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  52.59 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  56.88 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  60 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  58.04 
 
 
116 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
114 aa  124  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  60.19 
 
 
117 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
118 aa  124  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
116 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 
146 aa  124  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
118 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  53.98 
 
 
115 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
118 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  58.93 
 
 
116 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  57.66 
 
 
115 aa  123  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
136 aa  123  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>