41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2408 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2408  OmpW family protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00013458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3960  hypothetical protein  54.76 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000187243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0073  outer membrane protein, putative  48.06 
 
 		 200 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  49.03 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0309  hypothetical protein  50.72 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000916474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0290  hypothetical protein  47.09 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3522  outer membrane protein, putative  51.46 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.550518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1159  OmpW family protein  40.18 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0561  hypothetical protein  39.46 
 
 		 196 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.01609e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0549  hypothetical protein  38.38 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000486601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1840  OmpW family protein  31.78 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  30.67 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  27.7 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000900043  hitchhiker  0.0000643724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  28.44 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  29.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  28.57 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  28.04 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  29.53 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  29.53 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  26.07 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  26.07 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  30.16 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3523  OmpW family protein  29.45 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.11983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  27.41 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  31.25 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  28.77 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  29.2 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  33.14 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  27.73 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  25.76 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  26.89 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  27.98 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  26.89 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  27.4 
 
 		 212 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  27.4 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  0.00000160145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  27.4 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  27.4 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  27.4 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  27.4 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>