30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1159 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1159  OmpW family protein  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0073  outer membrane protein, putative  37.67 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2408  OmpW family protein  40.18 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00013458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0290  hypothetical protein  39.65 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3960  hypothetical protein  41.59 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000187243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  38.67 
 
 		 199 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0309  hypothetical protein  40.09 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000916474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3522  outer membrane protein, putative  39.91 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.550518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1840  OmpW family protein  39.01 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0549  hypothetical protein  32.21 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000486601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0561  hypothetical protein  32.35 
 
 		 196 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.01609e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 459 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  30.99 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  36.23 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  26.79 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  42.03 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  28.08 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  26.06 
 
 		 459 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  30.48 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  37.68 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  29.73 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.03 
 
 		 427 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  29.09 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 443 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  31.71 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  36.23 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  26.28 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  29.8 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  30.08 
 
 		 290 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>