21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0290 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0290  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0309  hypothetical protein  86.93 
 
 		 199 aa  324  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000916474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2408  OmpW family protein  47.09 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00013458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3960  hypothetical protein  49.76 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000187243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0073  outer membrane protein, putative  47.8 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  42.23 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.01609e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3522  outer membrane protein, putative  48.29 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.550518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0549  hypothetical protein  41.38 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000486601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1159  OmpW family protein  39.65 
 
 		 224 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1840  OmpW family protein  29.86 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 		 466 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0238  OmpW  27.27 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  28.5 
 
 		 468 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0620  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364082 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0625  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0593  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  28 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  28 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  28 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  24.07 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>