20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0309 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000916474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0290  hypothetical protein  86.93 
 
 		 199 aa  347  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2408  OmpW family protein  50.49 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00013458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3960  hypothetical protein  50.48 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000187243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0073  outer membrane protein, putative  48.78 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  44.66 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1159  OmpW family protein  40.09 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0561  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.01609e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0549  hypothetical protein  42.31 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000486601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3522  outer membrane protein, putative  46.34 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.550518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1840  OmpW family protein  28.96 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0593  hypothetical protein  30.17 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0620  hypothetical protein  30.17 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364082 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0625  hypothetical protein  30.17 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  26.73 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  27.43 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  27.43 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  27.43 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2819  hypothetical protein  25.79 
 
 		 397 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  27.18 
 
 		 420 aa  41.2  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>