25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0073 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0073  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3522  outer membrane protein, putative  64.36 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.550518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2408  OmpW family protein  48.06 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00013458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3960  hypothetical protein  52.15 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000187243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0290  hypothetical protein  47.8 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0309  hypothetical protein  48.78 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000916474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  43.63 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1159  OmpW family protein  37.67 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0561  hypothetical protein  38.59 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.01609e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0549  hypothetical protein  37.36 
 
 		 196 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000486601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1840  OmpW family protein  34.27 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  25.35 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  30.14 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  30.23 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  27.7 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  30.77 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 		 466 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  31.21 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  29.26 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  29.26 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1244  OmpW  26.98 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000847221  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  31.65 
 
 		 255 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2144  hypothetical protein  31.18 
 
 		 249 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.67 
 
 		 427 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  30.66 
 
 		 459 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>