More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0212 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
372 aa  759    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  79.14 
 
 
374 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  79.14 
 
 
374 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  75 
 
 
376 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  78.71 
 
 
372 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  77.36 
 
 
373 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  62.16 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  57.95 
 
 
374 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  57.41 
 
 
374 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  57.41 
 
 
371 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  59.46 
 
 
376 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  56 
 
 
377 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  56.01 
 
 
377 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  55.71 
 
 
379 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  55.04 
 
 
378 aa  408  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  55.04 
 
 
378 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  55.71 
 
 
379 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  55.71 
 
 
379 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  55.71 
 
 
379 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  56.13 
 
 
376 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  55.71 
 
 
379 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  56.13 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  55.86 
 
 
376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  56.13 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  55.59 
 
 
377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  55.74 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  56.13 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  56.13 
 
 
376 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  56.13 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  56.13 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  56.13 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  58.5 
 
 
375 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  54.62 
 
 
379 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  54.62 
 
 
379 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  54.62 
 
 
379 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  54.18 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  55.75 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  55.75 
 
 
379 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  54.16 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  57.8 
 
 
397 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  58.09 
 
 
374 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  57.8 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  56.36 
 
 
376 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  58.09 
 
 
374 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  57.06 
 
 
378 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  57.23 
 
 
375 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  55.14 
 
 
374 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  53.28 
 
 
375 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 
380 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  56.77 
 
 
378 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  56.91 
 
 
382 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  54.37 
 
 
389 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  54.22 
 
 
378 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  54.03 
 
 
382 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  54.4 
 
 
378 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  51.61 
 
 
375 aa  388  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  51.09 
 
 
372 aa  389  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  55.16 
 
 
377 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  55.16 
 
 
377 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  54.25 
 
 
376 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  56.86 
 
 
377 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  53.19 
 
 
382 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1403  chaperone protein DnaJ  74.31 
 
 
384 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00904898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  54.5 
 
 
375 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  54.35 
 
 
377 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  57.43 
 
 
380 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  56.86 
 
 
377 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  55.41 
 
 
372 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  54.35 
 
 
377 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
382 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  54.89 
 
 
377 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  54.62 
 
 
376 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  57.51 
 
 
376 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  54.35 
 
 
377 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  54.35 
 
 
377 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  54.59 
 
 
386 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  53.24 
 
 
373 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
375 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  56.33 
 
 
383 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  58.33 
 
 
380 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  53.56 
 
 
379 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 
373 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  50.4 
 
 
379 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  50.26 
 
 
380 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  50.95 
 
 
375 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  53.23 
 
 
374 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  52.01 
 
 
380 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  55.46 
 
 
376 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
378 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
378 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
378 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  55.68 
 
 
385 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1471  chaperone protein DnaJ  58.67 
 
 
381 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00621305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  53.49 
 
 
379 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  53.91 
 
 
374 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 
378 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  50.53 
 
 
378 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  50.27 
 
 
376 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  50.27 
 
 
376 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  50.8 
 
 
376 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>