26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0020 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
481 aa  980    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  53.1 
 
 
437 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  49.32 
 
 
442 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2220  heat shock protein DnaJ domain protein  49.77 
 
 
441 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2007  heat shock protein DnaJ domain protein  48.76 
 
 
441 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8484999999999997e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  39.15 
 
 
452 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  37.02 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.26 
 
 
248 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  37.63 
 
 
507 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
962 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  35.48 
 
 
344 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  28.68 
 
 
486 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  32.43 
 
 
474 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  36.3 
 
 
1085 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  31.53 
 
 
724 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  35.44 
 
 
175 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  39.73 
 
 
373 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  36.99 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  32.52 
 
 
467 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.03 
 
 
1655 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  37.5 
 
 
349 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  40 
 
 
468 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  30.89 
 
 
400 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  29.13 
 
 
503 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0098  hypothetical protein  40 
 
 
276 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  36.25 
 
 
219 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>