78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3403 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 		 231 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  61.33 
 
 		 222 aa  251  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  61.33 
 
 		 223 aa  248  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  60 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  57.66 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  58.41 
 
 		 231 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  60 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  58.67 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  63.18 
 
 		 225 aa  237  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  64.44 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  60 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  58.22 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  52.75 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45.81 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  45 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  43.69 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  37.22 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  41.96 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  35.75 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  35.75 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  42.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.29 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  43.97 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  32.43 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  34.13 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  32.69 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  32.21 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  43.46 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  38.79 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  35.55 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  33.18 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  35.02 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  37.78 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  37.5 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.49 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  30.7 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  41.7 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.52 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.28 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  32.86 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  32.32 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  36.74 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.51 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.85 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.38 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.18 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  40 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.39 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.88 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  38.03 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  34.03 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.37 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  36.18 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.3 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  37.36 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  32.97 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.93 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.77 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.33 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.72 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  28.02 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.4 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.95 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.94 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.94 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  35.07 
 
 		 188 aa  48.9  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  34.87 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.58 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.64 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.16 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  37.5 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.64 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  26.37 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.96 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.54 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.87 
 
 		 259 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>