51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2980 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2980  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
295 aa  577  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4785  alpha/beta hydrolase fold protein  60.28 
 
 
289 aa  334  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  54.36 
 
 
288 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.439503  hitchhiker  0.00517721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1268  hypothetical protein  52.63 
 
 
290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0354701  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  52.61 
 
 
287 aa  251  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0121  hypothetical protein  48.94 
 
 
287 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5099  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3267  alpha/beta hydrolase fold protein  39.59 
 
 
277 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1562  alpha/beta hydrolase fold protein  40.42 
 
 
281 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424412  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6037  hypothetical protein  39.64 
 
 
273 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6963  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 
282 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  38.23 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4947  putative hydrolase  39.51 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 
285 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0153  hydrolase  31.44 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  31.44 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  31.44 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  31.44 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  30.82 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  30.82 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0078  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
277 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 
394 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  36 
 
 
285 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.85 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  35.43 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  44.16 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  25.98 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.03 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  32.64 
 
 
556 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 
344 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  32.48 
 
 
317 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  32.48 
 
 
317 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 
287 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>