57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2489 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  50.34 
 
 		 1034 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  49.33 
 
 		 1034 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 1074 aa  2140    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.85 
 
 		 428 aa  141  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.23 
 
 		 378 aa  139  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.92 
 
 		 626 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.58 
 
 		 628 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.26 
 
 		 439 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.35 
 
 		 632 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  32.71 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.63 
 
 		 440 aa  107  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  32.99 
 
 		 403 aa  106  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.91 
 
 		 432 aa  105  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.8 
 
 		 889 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.81 
 
 		 446 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.95 
 
 		 824 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.16 
 
 		 356 aa  98.6  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  29.89 
 
 		 429 aa  90.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  27.91 
 
 		 586 aa  81.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.75 
 
 		 457 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.3 
 
 		 1061 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.71 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.8 
 
 		 773 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  27.24 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.44 
 
 		 379 aa  73.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.2 
 
 		 262 aa  73.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  32.28 
 
 		 751 aa  72.4  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  28.75 
 
 		 815 aa  72  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  25.13 
 
 		 502 aa  67.4  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  27.59 
 
 		 770 aa  63.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.08 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.71 
 
 		 406 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  23.15 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  28.66 
 
 		 356 aa  54.7  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.51 
 
 		 414 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.51 
 
 		 414 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.51 
 
 		 414 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  30.77 
 
 		 633 aa  54.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  27.81 
 
 		 879 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  27.61 
 
 		 781 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  30 
 
 		 666 aa  52  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  29.48 
 
 		 811 aa  51.6  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.02 
 
 		 563 aa  51.6  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  26.42 
 
 		 507 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  26.35 
 
 		 918 aa  50.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.78 
 
 		 375 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  31.01 
 
 		 375 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  28.49 
 
 		 666 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.58 
 
 		 361 aa  46.2  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  35.14 
 
 		 867 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  35.14 
 
 		 871 aa  46.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  35.14 
 
 		 865 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  36 
 
 		 935 aa  45.8  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  28.57 
 
 		 945 aa  45.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.52 
 
 		 557 aa  45.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.31 
 
 		 559 aa  44.7  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>