22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1682 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3542  ABC transporter integral membrane protein  80.65 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3541  hypothetical protein  83.33 
 
 		 62 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  35.05 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  31.66 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  28.16 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  30.18 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  32.64 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  33.68 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  29.37 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  29.35 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.78 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  25.4 
 
 		 251 aa  45.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  26.1 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  30.7 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4408  hypothetical protein  31.13 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 379 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18440  hypothetical protein  35.35 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.59801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0912  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  26.45 
 
 		 675 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0301112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.56 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>