61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1330 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  54 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  45.62 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  43.12 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  38.16 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  36.62 
 
 		 369 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  31.61 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  39.88 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  38.76 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  28.36 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  23.43 
 
 		 357 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  33.42 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  32.46 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  34.33 
 
 		 374 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  33.02 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  32.86 
 
 		 393 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  32.83 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  27.38 
 
 		 389 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  28.7 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  27.88 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  32.1 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  29.3 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  31.37 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  20.75 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  30.36 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  28.65 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  28.36 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  29.71 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  27.38 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  31.75 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  28.33 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  28.32 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  36.03 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  30.42 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  28.53 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  27.03 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  32.72 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  29.39 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  28.11 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  19.35 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  28.7 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  31.88 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  35.16 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  34.67 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  33.53 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  33.53 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  28.32 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  30.04 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  29.58 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  29.58 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  31.54 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  31.11 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  29.22 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  27.93 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  23.23 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  27.83 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  28.19 
 
 		 383 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  34.96 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0629  hypothetical protein  25.95 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  28.34 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  27.73 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>