98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0934 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  100 
 
 
511 aa  1004    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  66.6 
 
 
463 aa  587  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  66.6 
 
 
503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  68.14 
 
 
471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  68.32 
 
 
469 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  66.04 
 
 
465 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  66.94 
 
 
507 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  63.2 
 
 
475 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  63.89 
 
 
476 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  63.12 
 
 
461 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  60.57 
 
 
462 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  60.74 
 
 
473 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  60.61 
 
 
475 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  58.66 
 
 
469 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  58.51 
 
 
480 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  60.37 
 
 
463 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  60.51 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  59.34 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  59.71 
 
 
461 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  59.71 
 
 
461 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  59.71 
 
 
461 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  57.97 
 
 
478 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  57.71 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  59.08 
 
 
464 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.32 
 
 
464 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.12 
 
 
475 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.96 
 
 
460 aa  395  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.83 
 
 
505 aa  379  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.79 
 
 
499 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.07 
 
 
502 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  44.1 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  42.17 
 
 
497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  47.03 
 
 
487 aa  357  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.16 
 
 
487 aa  356  5e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  48.49 
 
 
510 aa  352  8e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  44.82 
 
 
473 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  41.31 
 
 
512 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.13 
 
 
486 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  43.55 
 
 
473 aa  343  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.91 
 
 
357 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  27.62 
 
 
334 aa  57  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.44 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.16 
 
 
341 aa  53.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  26.3 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.86 
 
 
369 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  30.81 
 
 
362 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.79 
 
 
377 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.14 
 
 
373 aa  52  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  26.42 
 
 
334 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  26.42 
 
 
334 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  31.25 
 
 
363 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  31.71 
 
 
309 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  28.28 
 
 
304 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  25.94 
 
 
334 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  33.33 
 
 
309 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.58 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.14 
 
 
358 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  27.69 
 
 
304 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.14 
 
 
358 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.18 
 
 
337 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  32.41 
 
 
334 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  24.33 
 
 
335 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.57 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  28.49 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.18 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.5 
 
 
336 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.18 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.27 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.75 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  24.65 
 
 
326 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  26.51 
 
 
719 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  24.05 
 
 
335 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.22 
 
 
340 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  27.32 
 
 
509 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.56 
 
 
324 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.79 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  22.89 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  30.3 
 
 
620 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  37.5 
 
 
325 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  30.46 
 
 
507 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.08 
 
 
362 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  30.46 
 
 
507 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  30.46 
 
 
507 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.32 
 
 
678 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5417  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.43 
 
 
456 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.83 
 
 
306 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.23 
 
 
379 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  31.03 
 
 
352 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  30.06 
 
 
331 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.02 
 
 
394 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.93 
 
 
348 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  27.5 
 
 
347 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  30.21 
 
 
335 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.8 
 
 
368 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.47 
 
 
343 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.829729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  26.29 
 
 
507 aa  43.9  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0878  hypothetical protein  29.41 
 
 
321 aa  43.5  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000906257  hitchhiker  0.00000551742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.33 
 
 
611 aa  43.5  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>