More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0433 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0433  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 634 aa  1236    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.811397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1178  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 		 950 aa  360  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0144635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 897 aa  340  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 1297 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1665  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 937 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175798  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3137  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 		 866 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00387942  normal  0.129618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  33.57 
 
 		 2137 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  33.67 
 
 		 5469 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.18 
 
 		 13537 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  35.26 
 
 		 5698 aa  228  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 		 1525 aa  226  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.11 
 
 		 3942 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.33 
 
 		 4332 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  34.46 
 
 		 1083 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  31.41 
 
 		 5213 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.92 
 
 		 1806 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  28.68 
 
 		 1157 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  28.66 
 
 		 1157 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  32.36 
 
 		 2448 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 1466 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.33 
 
 		 2666 aa  220  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  29.01 
 
 		 1466 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  33.96 
 
 		 612 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0745582  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  28.71 
 
 		 1069 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1638  peptide synthetase-domain-containing protein  33.96 
 
 		 612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1415  peptide synthetase-domain-containing protein  33.96 
 
 		 612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2525  amino acid adenylation domain-containing protein  33.96 
 
 		 633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2140  peptide synthetase-domain-containing protein  33.96 
 
 		 633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3173  peptide synthetase-domain-containing protein  33.96 
 
 		 612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  31.29 
 
 		 5738 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.02 
 
 		 1160 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 		 1569 aa  218  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.28 
 
 		 4336 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2667  peptide synthetase-domain-containing protein  34.26 
 
 		 630 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  30.39 
 
 		 1142 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  31.62 
 
 		 1753 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  28.45 
 
 		 627 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  32.04 
 
 		 6676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.79 
 
 		 2720 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.71 
 
 		 4317 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.86 
 
 		 4317 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.72 
 
 		 4317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  30.29 
 
 		 4968 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.79 
 
 		 3695 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.84 
 
 		 1769 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  29.72 
 
 		 1093 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  34.88 
 
 		 2605 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  31.05 
 
 		 7168 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3419  amino acid adenylation domain protein  32.55 
 
 		 1872 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  32.15 
 
 		 1405 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3791  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 867 aa  211  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0584579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  32.89 
 
 		 1726 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  32.2 
 
 		 5230 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  32.46 
 
 		 2626 aa  210  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.88 
 
 		 2154 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  32.47 
 
 		 6176 aa  210  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  33.39 
 
 		 2573 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32.55 
 
 		 4317 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  29.79 
 
 		 1518 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  29.87 
 
 		 2878 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.33 
 
 		 4882 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  32.78 
 
 		 4336 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  34.24 
 
 		 2606 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.69 
 
 		 4991 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  29.36 
 
 		 2625 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.64 
 
 		 9498 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  32.76 
 
 		 5422 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3684  amino acid adenylation domain protein  33.77 
 
 		 2109 aa  207  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  32.99 
 
 		 4318 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.1 
 
 		 7122 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  33.17 
 
 		 1779 aa  207  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.63 
 
 		 1336 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  33.86 
 
 		 2651 aa  207  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  28.45 
 
 		 1454 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  31.27 
 
 		 1745 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  31.86 
 
 		 5926 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34 
 
 		 1776 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.03 
 
 		 4747 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  33.5 
 
 		 2403 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  32.43 
 
 		 5929 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.1 
 
 		 3331 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.21 
 
 		 1839 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  33.57 
 
 		 1334 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.81 
 
 		 6889 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.68 
 
 		 3231 aa  205  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  29.03 
 
 		 2193 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27 
 
 		 1833 aa  205  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.31 
 
 		 7541 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  31.21 
 
 		 1745 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  32.6 
 
 		 2710 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  31.21 
 
 		 1745 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.04 
 
 		 5953 aa  203  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  31.9 
 
 		 1383 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  33.33 
 
 		 3352 aa  203  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  32.53 
 
 		 3208 aa  203  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  33.33 
 
 		 3328 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  34.45 
 
 		 8211 aa  203  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  31.35 
 
 		 1314 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.5 
 
 		 6072 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.76 
 
 		 8914 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>