More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3419 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  33.23 
 
 
3470 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.21 
 
 
1870 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.75 
 
 
4317 aa  697    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.49 
 
 
5953 aa  746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.14 
 
 
6889 aa  780    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.68 
 
 
4318 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  32.5 
 
 
4336 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  32.83 
 
 
2125 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  34.28 
 
 
2151 aa  786    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  32.74 
 
 
1553 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  32.78 
 
 
2571 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.47 
 
 
2370 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.84 
 
 
3432 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  29.69 
 
 
7168 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.06 
 
 
5738 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3431  amino acid adenylation domain protein  37.79 
 
 
1813 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
2164 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  30.38 
 
 
2193 aa  777    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.66 
 
 
4960 aa  816    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 
6661 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.68 
 
 
7122 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  28.49 
 
 
4196 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.57 
 
 
4336 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  32.38 
 
 
5596 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  34.57 
 
 
2154 aa  780    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.87 
 
 
4317 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.04 
 
 
9498 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.77 
 
 
13537 aa  785    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.15 
 
 
6676 aa  834    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  35.44 
 
 
2577 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.01 
 
 
2867 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.19 
 
 
7310 aa  703    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  35.6 
 
 
3308 aa  924    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.53 
 
 
3498 aa  880    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.22 
 
 
2033 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.95 
 
 
4317 aa  708    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  36.49 
 
 
8211 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  32.76 
 
 
2155 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.66 
 
 
3291 aa  882    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  29.67 
 
 
3086 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  33.35 
 
 
6072 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.96 
 
 
1556 aa  738    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.67 
 
 
3086 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  33.12 
 
 
1556 aa  738    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.86 
 
 
4502 aa  752    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  33.58 
 
 
1569 aa  808    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.72 
 
 
4882 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  30.15 
 
 
2006 aa  652    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.62 
 
 
4960 aa  807    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.39 
 
 
4332 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.97 
 
 
3942 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  35.73 
 
 
5750 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  30.87 
 
 
4037 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33.35 
 
 
7712 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  33.72 
 
 
5230 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.12 
 
 
4991 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  32.85 
 
 
1578 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  33.73 
 
 
4290 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  35.62 
 
 
4489 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.11 
 
 
1870 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 
4090 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.95 
 
 
4342 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  32.78 
 
 
2571 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.23 
 
 
6403 aa  830    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.18 
 
 
2138 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34 
 
 
4478 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.91 
 
 
4342 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  32.45 
 
 
2573 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  37.3 
 
 
2189 aa  796    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  36.33 
 
 
2448 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.37 
 
 
5328 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  36.72 
 
 
3639 aa  780    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.48 
 
 
2156 aa  672    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
2201 aa  738    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  28.1 
 
 
2156 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  32.4 
 
 
1689 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.1 
 
 
4968 aa  807    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.47 
 
 
1550 aa  799    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.79 
 
 
4317 aa  698    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  34.14 
 
 
7785 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.81 
 
 
4747 aa  705    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  33.93 
 
 
5213 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.15 
 
 
8914 aa  807    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.12 
 
 
2156 aa  670    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  33.99 
 
 
3331 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3419  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1872 aa  3719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.42 
 
 
2581 aa  802    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  31.39 
 
 
9175 aa  694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  33.69 
 
 
6081 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  31.49 
 
 
3453 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  35.1 
 
 
2614 aa  635  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  31.95 
 
 
2174 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3578  amino acid adenylation domain protein  34.6 
 
 
2098 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341222  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  32.63 
 
 
2477 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.09 
 
 
5926 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  30.52 
 
 
4354 aa  629  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3433  condensation domain protein  43.95 
 
 
1094 aa  625  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.99 
 
 
4531 aa  623  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.49 
 
 
2791 aa  623  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.93 
 
 
2720 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>