More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0336 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0336  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  782    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3920  glycosyl transferase, group 1  45.71 
 
 
411 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026884  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3905  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3979  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4060  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
368 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586915  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  35.86 
 
 
364 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  33.16 
 
 
340 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
368 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3683  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 
402 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  35.25 
 
 
360 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 
354 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 
400 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.06 
 
 
354 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
363 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.97 
 
 
354 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
355 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.97 
 
 
354 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.97 
 
 
354 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.97 
 
 
354 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
365 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  30.13 
 
 
354 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
367 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  28.54 
 
 
357 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2759  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
348 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0642938  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
354 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
354 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
372 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
354 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3902  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
342 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
349 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
354 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
354 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
354 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
355 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  32.47 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
355 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
386 aa  127  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.71 
 
 
376 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
354 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
354 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
354 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
354 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
354 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
354 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  26.98 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
373 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0199  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
346 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
362 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
354 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  28.68 
 
 
354 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0283  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
346 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  28.5 
 
 
355 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
354 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
354 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
354 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  27.08 
 
 
354 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
354 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
354 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 
354 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2704  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.825496  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
355 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2085  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
346 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
354 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
354 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0705  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
353 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
364 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
354 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>